Образован согласно Постановлению Правительства РК № 415 от 10 апреля 1996 года «О создании государственного национального природного парка «Кокшетау» и приказа Комитета лесного хозяйства Республики Казахстан от 11 июня 1996 г.на площади 78 561 га.

В 1999 г. Постановлением Правительства РК от 23 августа 1999 года № 1220 «Некоторые вопросы государственного учреждения «Государственный национальный природный парк «Кокшетау» площадь парка увеличилась на 46 234 га.

В 2002 г. на основании Постановлении Правительства Республики Казахстан от 29 декабря 2002 года № 1432 «О переводе отдельных участков земель особо охраняемых природных территорий в земли других категорий» из территории парка переведено в категорию земель оздоровительного назначения 8,37 га.

В 2012 г. в соответствии с Постановлением Правительства Республики Казахстан от 18 октября 2012 года № 1323 «О некоторых вопросах государственного учреждения «Государственный национальный природный парк «Кокшетау» Комитета лесного и охотничьего хозяйства Министерства сельского хозяйства Республики Казахстан» из ГНПП «Кокшетау» было передано Орлиногорскому ГУ лесного хозяйства 1780 га, одновременно парку предоставлено право постоянного землепользования на 829 га земель населенных пунктов и 951 га земель запаса Айыртауского района Северо-Казахстанской области.

В настоящее время площадь Нац.парка составляет - 182 076 га.

Основная цель создания парка - сохранение и восстановление уникальных, лесо-степных и озерных экосистем, редких видов флоры и фауны, памятников природы, археологии и национальной культуры Северного Казахстана, имеющих особое экологическое, научно-просветительское и рекреационное значение.

Описание границ

Природный парк расположен на севере Акмолинской области и Северо-Казахстанской области. Представлен горно-лесными ландшафтами Зерендинской, Шалкарской, Имантауской и Айртауской природных зон включающие озерные акватории озер Зеренда, Шалкар, Имантау, Саумалколь и Северо-Казахстанской, Зерендинского района. Регион часто сравнивают со Швейцарией, так как ландшафты во многом схожи. Регион на 60% покрыт лесами, которые чередуются со степными зонами покрытых преимущественно типчако-ковыльной растительностью.

Фауна

Фауна национального парка «Кокшетау» представлена 51 видом млекопитающих , 224 видами птиц , 5 видами пресмыкающихся, 1 видом земноводных, 19 видами рыб. Из копытных зверей здесь обитают: сибирская косуля (Capreоlus pygаrgus), лось (Alces sp.), кабан (Sus scrofa). В 1983 г. завезен асканийский олень, который хорошо акклиматизировался. Из хищных встречаются: волк (Canis lupus), лисица (Vulpes vulpes), корсак (Vulpes corsac), барсук (Meles meles), горностай (Mustela erminea), ласка (Mustela nivalis), степной хорь (Mustela eversmanni). В последние годы проникла из северных областей енотовидная собака (Nyctereutes procyonoides). В лесу обычен заяц-беляк (Lepus timidus), по лесным опушкам – заяц-русак (Lepus europaeus). Из грызунов характерны акклиматизированная белка-телеутка (Sciurus vulgaris exalbidus), краснощекий суслик (Spermophilus erythrogenys), большой тушканчик (Allactaga major), обыкновенный хомяк (Cricetus cricetus), полевки, мыши, крысы. Встречаются обыкновенный еж (Erinaceus europaeus) и ушастый еж (Hemiechinus auritus), бурозубки, летучие мыши. В Красную книгу Казахстана внесена лесная куница (Martes martes). Из птиц фоновыми видами являются грач, сорока, серая ворона, полевой воробей, обыкновенная пустельга. Из хищных птиц для парка характерны кобчик, чеглок, балобан, черный коршун. В лесу встречаются большой и малый пестрый дятлы, дрозды – деряба и белобровик, лесной конек, зяблик, кукушка, иволга, тетерев, горлицы, овсянки, синицы, пеночки. На озёрах обычны утки, гуси, лебеди, поганки, а по их берегам – цапли, кулики, трясогузки. 28 видов птиц включены в Красную книгу Казахстана: кудрявый пеликан (Pelecanus crispus); черный аист (Ciconia nigra); гусь пискулька (Anser erythropus); краснозобая казарка (Rufibrenta ruficollis); лебедь – кликун (Cygnus cygnus); черный турпан (Mellanitta fusca); савка (Oxyura leucocephala); скопа (Pandion haliaetus); орел-карлик (Aquila pennatus); степной орел (Aquila rapax); могильник (Aguila heliaca); беркут (Aquila chrysaёtus); орлан-белохвост (Haliaeetus albicilla); кречет (Falco rusticolus); балобан (Falco cherrug); сапсан (Falco peregrinus); серый журавль (Grus grus); журавль красавка (Anthropoides virgo); дрофа (Otis tarda); стрепет (Otis tetrax); кречетка (Chettusia gregaria); черноголовый хохотун (Larus ichthyaetus); филин (Bubo bubo); лесная куница (Martes martes); красотка девушка (Calopteryx virgo); дыбка степная (Saga pedo); севчук Сервилля (Onconotus servillei); сколия степная (Scolia hirta); червец карминоносный польский (Рorphyrophora polonica). Из рептилий обитают: прыткая и живородящая ящерицы, узорчатый полоз, обыкновенная и степная гадюки, обыкновенный уж. Из амфибий – зеленая жаба, травяная и остромордая лягушки. Из рыб встречаются карась, щука, окунь, плотва, язь, линь, налим. Фауна беспозвоночных животных (насекомых, пауков, клещей, моллюсков, червей и др.) еще полностью не выяснена. В целом для лесостепи установлено обитание около 1000 видов жуков, 220 видов клопов, 70 видов прямокрылых (кузнечики, сверчки, саранчовые и др.), 64 вида пауков. 17 видов (птицы, рыбы, рептилии, млекопитающие), обитающих на территории Парка, включены в список Международного союза охраны природы и природных ресурсов (МСОП): пелядь (Coregonus peled); рипус (Coregonus albula); ящерица прыткая (Lacerta agilis); пеликан кудрявый (Pelecanus crispus); казарка краснозобая (Rufibrenta ruficollis); савка (Oxyura leucocephala); белоглазая чернеть (Aythya nyroca); гусь – пискулька (Anser erythropus); подорлик большой (Aquila clanga); могильник (Aquila heliaca); лунь степной (Circus macrourus); орлан-белохвост (Haliaeetus albicilla); пустельга степная (Falco naumanii); сурок (Arctous marmota); корсак (Vulpus vulgaris); рысь (Lynx vulgaris); росомаха (Gulo borealis).

Флора

В парке сохраняются эталоны природных комплексов, генофонд редких и исчезающих видов организмов, неповторимые природные образования, ресурсы растительного и животного мира. Здесь произрастает более 800 видов сосудистых растений. В лесных сообществах насчитывается 800 видов растений. Основная древесная порода – сосна , занимающая подножья, склоны и вершины невысоких сопок и увалов, межсопочные равнины и ложбины. Сопутствующие древесные породы – березы ( бородавчатая и пушистая) и осина – образуют смешанные с сосной насаждения. Из кустарников встречаются можжевельник , кизильник, сирень, шиповник, боярышник, смородина. В Красную книгу Казахстана занесены: кладина оленья (Cladonia rangiferina); адонис весенний (Adonis vernalis); багульник болотный (Ledum palustre); башмачок настоящий (Cypripedium calceolus); башмачок крупноцветковый (Cypripedium macranthon); зимолюбка зонтичная (Chimaphila umbellata); кувшинка белая (Nymphaea alba); пион гибридный (Paeonia hybrida); росянка круглолистная (Drosera rotundifolia); пальчатокоренник Фукса (Dactylorhiza fuchsii); ковыль перистый (Stipa pennata). Среди группы низших растений имеется более 19 видов мхов, значительное число лишайников, папоротники. Встречаются бореальные виды - растения, распространенные только в хвойных лесах умеренной зоны: страусопер папоротниковый (Matteuccia struthiopteris); кочедыжник женский (Athyrium filix-femina); пузырник ломкий (Cystopteris filix-fragilis); голокучник трехперый (Gymnocarpium dryopteris); голокучник тончайший (Gymnocarpium tenuipes); голокучник робертовский (Gymnocarpium robertianum); костенец северный (Asplenium septentrionale); многоножка обыкновенная (Polipodium vulgare); орляк обыкновенный (Pteridium aguilinum); телиптерис болотный (Thelipteris palustris); щитовник мужской (Dryopteris filix mas); хвощ лесной (Eguisetum sylvaticum); хвощ луговой (Eguisetum prаtense); хвощ зимующий (Eguisetum hiemale); вейник тростниковый (Calamagrostis arundinaceae); коротконожка перистая (Brachypodium pinnatum); осока омская (Cyperus omsciana); купена обыкновенная (Polygonatum officinale); гудайера ползучая (Goodyera repens); гнездоцветка клобучковая (Neottianthe cucullata); ладьян трехнадрезанный (Corallorhiza trifida); дремлик болотный (Epipactis palustris); пальчатокоренник пятнистый (Dactylorhiza maculate); калужница болотная (Caltha palustris); земляника лесная (Fragaria vesca); герань лесная (Geranium sylvaticum); борщевик сибирский (Heracleum sibiricum); сныть обыкновенная (Aegopodium podagraria); дудник лесной (Angelica silvestris); зимолюбка зонтичная (Chimaria umbellate); грушанка зеленоватая (Pyrola virescens); грушанка круглолистная (Pyrola rotundifolia); грушанка малая (Pyrola minor); одноцветка одноцветковая (Moneses uniflora); рамишия однобокая (Ramischia secunda); линнея северная (Linnaea borealis); сивец луговой (Succisa pratensis)