Постановление Правительства Республики Казахстан от 22 февраля 1996 года №228 «О создании Иле-Алатауского Государственного национального природного парка в Алматинской области» на площади составляла 202 292 га.
Парк создан на базе Заилийского лесохозяйственного объединения Комитета лесного хозяйства РК и Тургенского плодового механизированного лесхоза МСХ РК.
Согласно постановления Правительства Республики Казахстан № 1074 от 10 ноября 2006 года площадь парка уменьшилась и составила 199 703 га.
Указом Президента РК "Об изменении границ города Алматы" от 21.09.2012 г. - выведено из территории ГНПП "Иле-Алатауский" 11 920,93 га и эти земли переведены в земли г.Алматы.
Постановлением Правительства Республики Казахстан от 11 мая 2014 года № 474 "О переводе отдельных участков земель особо охраняемых природных территорий в земли запаса в Алматинской и Южно-Казахстанской областях" выведено из состава ГНПП "Иле-Алатауский" - 2,5 га под строительство объектов Гос. границы РК.
В декабре 2014 года осуществлен перевод земель особо охраняемых природных территорий республиканского государственного учреждения «Иле-Алатауский государственный национальный природный парк» общей площадью 1002,0 гектара в категорию земель запаса Медеуского района города Алматы под строительство курорта «Кок-Жайляу», согласно постановления Правительства Республики Казахстан от 2 декабря 2014 года № 1267
Постановлением Правительства Республики Казахстан от 16 мая 2019 года № 293 "О переводе земель особо охраняемых природных территорий в земли запаса" - вывели из состава "Иле-Алатауского ГНПП" - 49,7306 га для строительства селезащитных плотин.
Границы Парка претерпели множественные изменения и сейчас площадь Иле-Алатауского Государственного национального природного парка составляет - 186 400,2694 га.
Описание границ
Иле-Алатауский ГНПП расположен вдоль северного склона гор Заилийского Алатау от реки Шамалган на западе до реки Шолак на востоке. Его протяженность с запада на восток 120 км, а в поперечнике 30 км. Южная граница ГНПП проходит по основному хребту Заилийского Алатау, причем с юго-западной стороны частично граничит с государственной границей между Казахстаном и Кыргызской Республикой. Северная граница парка проходит по предгорью Заилийского Алатау, захватывая дикоплодовые леса.
Флора
Флора природного парка насчитывает более 1000 видов, большая часть которых приходится на флору лесного среднегорного пояса. В лиственных лесах сосредоточено более 500, а в еловых — более 400 видов высших растений. В Красную книгу занесены: стланиковая форма ели Шренка (Picea schrenkiana Fisch. et Mey. f. prostrate); печеночница Фальконера (Hepatica falconeri); адонис золотистый (Adonis chrysocyathus); адонис тяньшанский (Adonis tianschanica); голосемянник алтайский (Gymnospermium altaicum); пион Марьин-корень (Paeonia anomala); пион гибридный (Paeonia hybrida); хохлатка Семенова (Corydalis semenovii); курчавка Мушкетова (Аtraphaxis muschketovii); ревень Виттрока (Rheum wittrockii); иконниковия Кауфмана (Ikonnikovia kaufmanniana); кауфмания Семенова (Kaufmannia semenovii); желтушник оранжевый (Erisimum croceum); неуролома Бекетова (Neuroloma beketovii); крупка мелкоплодная (Draba microcarpella); каркас кавказский (Celtis caucasica); молочай Ярослава (Euphorbia jaroslavii); смородина Янчевского (Ribes janczevskii); сибирка тяньшаньская (Sibiraea tianschanica); яблоня Сиверса (Malus sieversii); абрикос обыкновенный (Armeniaca vulgaris); астрагал джимский (Astragalus dshimensis); остролодочник алматинский (Oxytropis almaatensis); эспарцет алатауский (Onobrychis alatavica); пастернаковник ледниковый (Pastinacopsis glacialis); валериана снеголюбивая (Valeriana chionophila); вероника алатауская (Veronica alatavica); ястребинка кумбельская (Hieracium kumbelicum); одуванчик Виталия (Taraxacum vitalii); шмальгаузения гнездистая (Schmalhausenia nidulans); горькуша обернутая (Saussurea involucrate); наголоватка алматинская (Jurinea almaatensis); плагиобазис васильковый (Plagiobasis centauroides); касатик Альберта (Iris albertii); иридодикциум Колпаковского (Iridodictium kolpakowskianum); онона алматинская (Juno almaatensis); шафран алатауский (Crocus alatavicus); гусиный лук новый Попова (Gagea neo-popovii); тюльпан Островского (Тulipa ostrovskiana); тюльпан Колпаковского (Тulipa kolpakovskiana). Реликтами являются: пырей волосистый (Elytrigia trichophora); осока толстостолбиковая (Сarex pachystylis); эремурус мощный (Eremurus robustus); катран Кочи (Сrambe kotschyana); улугбекия чимганская (Ulugbeckia tschimganica); девясил крупнолистый (Inula macrophylla); щитовник мужской (Dryopteris filix); костенец волосовидный (Аsplenium trichomanes). Из множества полезных растений большой интерес представляет группа кормовых (более 80 видов): кобрезия волосовидная (Kobresia capillifolia), осока узкоплодная (Carex stenocarpa), овсяница Крылова (Festuca kryloviana), мятлик альпийский (Pоa alpína) и мятлик луговой (Poa pratеnsis), овсянец тяньшанский (Festuca tianschanica), ежа сборная (Dactylis glomerata), коротконожка перистая (Brachypodium pinnatum), виды регрении, клевера, чины, горошка. Из дубильных растений наиболее ценны разные виды горца, ревеня. Из эфирономасличных — дягиль, можжевельники, полыни. В качестве естественных красителей могут использоваться манжетки, подмаренник, макротония и др. Широко распространены лекарственные растения: пижма, тысячелистник обыкновенный (Brachypоdium pinnаtum), мать-и-мачеха (Tussilаgo fаrfara), шиповники, жостер, валериана сомнительная (Valeriana dubia), можжевельники, одуванчики, подорожники и др. Из пищевых особенно ценны: абрикос, яблоня, малина, смородина, земляника, костяника, ежевика, барбарис, облепиха, рябина, боярышники, шиповники. Многочисленны декоративные растения: первоцветы, водосборы, тюльпаны, ирисы, мелколепестники, колокольчики, горечавки, фиалки, различные виды деревьев и кустарников.
Фауна
К настоящему времени известны более 2000 видов из 8 классов. Частично выявлен состав некоторых отрядов класса насекомых. Так, из отряда жуков изучены 252 вида жужелиц, 180 — стафилинид, 102 — листоедов; из отряда чешуекрылых, или бабочек — 145 видов дневных бабочек; из отряда перепончатокрылых — 110 видов пчелиных, 97 — роющих ос, 33 — муравьев и 30 наездников. В Красную книгу Казахстана внесены: Земноводные - данатинская жаба (Bufo danatensis); Птицы - аист черный (Ciconia nigra); лебедь-кликун (Cygnus cygnus); змееяд (Circaetus gallicus); орел-карлик (Hieraaetus pennatus); орел степной (Aquila nipalensis); могильник (Aquila heliacal); беркут (Aquila chrysaetos); бородач (Gypaetus barbatus); стервятник (Neophron percnopterus); кумай (Gyps himalayensis); балобан (Falco cherrug); шахин (Falco pelegrinoides); сапсан (Falco peregrinus); журавль серый (Grus grus); журавль-красавка (Anthropoides virgo); серпоклюв (Ibidorhyncha struthersii); филин (Bubo bubo); птица синяя (Myophonus coeruleus); азиатская широкоушка (Barbastella leucomelas); Млекопитающие - тяньшанский бурый медведь (Ursus arctos isabellinus); красный волк (Cuon alpinus); каменная куница (Martes foina); среднеазиатская речная выдра (Lutra lutra seistanica); манул (Otocolobus manul); туркестанская рысь (Lynx lynx isabellinus); снежный барс (Panthera uncia); архар (Ovis ammon); индийский дикобраз (Hystrix indica). В горных реках и ручьях встречаются 8 видов рыб: голый осман (Gymnodiptychus dybowskii) и чешуйчатый осман (Diptychus maculatus), маринка (Schizothorax intermedius), гольян (Phoxis phoxinus), а в реке Тургень — акклиматизированная форель (Salmo trutta). Из восьми видов пресмыкающихся обычны: ящерицы - алайский гологлаз (Asymblepharus alaicus) и разноцветная ящурка (Eremias arguta), а также змеи — обыкновенный уж (Natrix natrix) и водяной уж (Natrix tessellata), разноцветный полоз (Hemorrhois ravergieri) и узорчатый полоз (Elaphe dione). Более редки ядовитые змеи — степная гадюка (Vipera ursinii) и щитомордник обыкновенный (Agkistrodon halus). 2 вида змей являются редкими для данной территории: полоз узорчатый (Elaphe dione); щитомордник обыкновенный (Agkistrodon halus). Разнообразие природных условий обуславливает видовое богатство птиц. Всего в национальном парке их отмечено 178 видов. По характеру пребыванию они делятся на три группы: гнездящихся — 105 видов, прилетающих на зимовку — 18, пролётных — 55 видов. В Красную книгу включены 11 видов (черный аист, орел-карлик, беркут, кумай, шахин, серпоклюв, филин, балобан — пролётный; сапсан и большая чечевица — зимующие). 4 вида птиц включены в список Международного союза охраны природы и природных ресурсов (МСОП): пустельга степная (Falco naumanni); коростель (Crex crex); сизоворонка (Coracias garrulus); гриф черный (Aegypius monachus).