Организован 10 апреля 1996 года площадью 209 553 га на территориях бывших: Капчагайского государственного охотничье-заповедного хозяйства, Алматинского государственного заповедника, питомника по полувольному содержанию животных (куланарий), коллективного сельскохозяйственного предприятия «Басчи».
Цель создания парка — сохранение уникальных экосистем Илийской межгорной котловины и их биоразнообразия, охрана геоморфологических и палеонтологических объектов, памятников истории и культуры в сочетании с экологическим туризмом при строгом соблюдении норм рекреационной емкости и нагрузки.
Описание границ
Парк расположен в долине реки Или на территории Алматинской области Казахстана. Занимает территорию, ограниченную с юга рекой Или и Капшагайским водохранилищем, с севера западными отрогами Джунгарского Алатау - горами Шолак, Матай Алтынемель и Кояндытау, с востока невысокими горами Актау.
В национальный парк входит северная часть акватории Капчагаиского водохранилища и правобережье р. Или, опустыненные горы Малые и Большие Калканы, Актау, Катутау, самые крайние юго-западные отроги Жунгарского Алатау (Шолак, Дегерес, Матай), южный склон хребта Алтын-Эмель и часть хребта Кояндытау, а также обширная межгорная долина Коныролен. Палеозойский массив Малые и Большие Калканы обнаженного типа, с интенсивным разрушением горных пород. Между массивами Калканов преобладающими ветрами нанесен громадный песчаный бархан, известный как уникальный феномен природы - «Поющая гора».Флора
Во флоре существующей территории ГНПП «Алтын Эмель» зарегистрировано 825 видов сосудистых растений, относящихся к 380 родам и 84 семействам. Среди них 25 видов внесено в Красную книгу Казахстана: рябчик бледноцветковый (Fritillaria pallidiflora); тюльпан Альберта (Тulipa alberti); тюльпан Колпаковского (Tulipa kolpakowskiana); тюльпан короткотычиночный (Tulipa brachystemon); тополь сизолистый (Populus pruinosa); каркас кавказский (Celtis caucasica); ревень Виттрока (Rheum wittrockii); смолевка Муслима (Silene muslimii); пион степной (Paeonia hybrida); водосбор Виталия (Aquilegia vitalii); печеночница Фальконера (Hepatica falconeri); голосемянник алтайский (Gymnospermium altaicum); барбарис илийский (Berberis iliensis); строгановия стрелолистая (Stroganovia sagittata); родиола розовая (Rhodiola rosea); яблоня Сивера (Malus sieversii); абрикос обыкновенный (Armeniaca vulgaris); чезнея джунгарская (Chesneya dshungarica); астрагал джимский (Astragalus dshimensis); цельнолистник джунгарский (Haplophyllum dshungaricum); прангос Гердера (Prangos herderi); волосореберник Голоскокова (Pilopleura goloskokovii); ферула илийская (Ferula iliensis); кермек Михельсона (Limonium michelsonii); лепехиниелла Михаила (Lepechiniella michaelis); жимолость илийская (Lonicera iliensis); астеротамнус кустарниковый (Asterothamnus fruticosus); плагиобазис васильковый (Plagyobasis centauroides).
Кроме того, более 30 видов являются эндемичными: тюльпан Альберта (Тulipa alberti); тюльпан Колпаковского (Тulipa kolpakovskiana); тюльпан короткотычиночный (Тulipa brachystemon); смолевка Муслима (Silene muslimii); водосбор Виталия (Aquilegia vitalii); барбарис илийский (Berberis iliensis); строгановия стрелолистая (Stroganovia sagittata); абрикос обыкновенный (Armeniaca vulgaris); чезнейя джунгарская (Chesneya dshungarica); астрагал джимский (Astragalus dshimensis); цельнолистник джунгарский (Haplophyllum dshungaricum); прангос Гердера (Prangos herderi); морковник скальный (Silaus saxatilis); волосореберник Голоскокова (Pilopleura goloskokovii); ферула илийская (Ferula iliensis); кермек Михельсона (Limonium michelsonii); лепехиниелла Михаила (Lepechiniella michaelis); жимолость илийская (Lonicera iliensis); астеротамнус кустарниковый (Asterothamnus fruticosus); ковыль семиреченский (Stipa heptapotamica); осока слабошероховатая (Сarex minutiscabra); лук Голоскокова (Allium golskokovii); лютик Мейнсхаузена (Ranunculus meinshausenii); астрагал Николая (Аstragalus nikolai); астрагал укороченный (Аstragalus abbreviatus); астрагал южноджунгарский (Аstragalus austrodshungaricus); астрагал новый Попова (Аstragalus neo-popovii); астрагал арганатский (Аstragalus arganaticus); остролодочник колючконосный (Oxytropis spinifer); кермек Семенова (Limonium semenovii); липучка Павлова (Lappula pavlovii); липучка алатавская (Lappula аlatavica); горькуша Липшица (Saussurea lipschitzii); горькуша увенчанная (Saussurea coronata); горькуша Залемана (Saussurea salemanni); одуванчик алатавский (Taraxacum alatavicum).
Встречаются реликты Джунгарского Алатау и Или-Балхашского бассейна: каркас кавказский (Celtis caucasica); ревень Виттрока (Rheum wittrockii); строгановия стрелолистая (Stroganovia sagittata); яблоня Сиверса (Malus sieversii); плагиобазис васильковый (Plagyobasis centauroides).
Фауна
Фауна позвоночных животных национального парка насчитывает 393 вида. На территории парка обитают 78 видов млекопитающих, 260 видов птиц, 25 видов пресмыкающихся, 4 вида земноводных, 26 видов рыб.
Установлено обитание 1658 видов беспозвоночных, в том числе по таксонам: прямокрылые — 56, богомоловые — 7, равнокрылые — 497, жесткокрылые — 536, чешуекрылые — 164, перепончатокрылые — 225, пухоеды и вши — 1, паукообразные — 140, моллюски — 32 вида.
Из обитающих в парке животных более 40 видов занесены в Красную книгу Казахстана: илийская маринка (Schizothorax argentatus pseudaksaiensis); балхашский окунь (Perca schrenki); данатинская жаба (Bufo danatensis); центральноазиатская лягушка (Rana asiatica); пестрая круглоголовка (Phrynocephalus versicolor); розовый пеликан (Pelecanus onocrotalus); кудрявый пеликан (Pelecanus crispus); колпица (Platalea leucorodia); черный аист (Ciconia nigra); лебедь-кликун (Cygnus cygnus); белоглазая чернеть (Aythya nyroca); савка (Oxyura leucocephala); скопа (Pandion haliaetus); змееяд (Circaetus gallicus); степной орел (Aquila nipalensis); могильник (Aquila heliaca); беркут (Aquila chrysaetus); орлан-белохвост (Haliaeetus albicilla); бородач (Gypaetus barbatus); стервятник (Neophron percnopterus); кумай (Gyps himalayensis); балобан (Falco cherrug); сапсан (Falco peregrinus); серый журавль (Grus grus); журавль-красавка (Anthropoides virgo); дрофа (Otis tarda); стрепет (Tetrax tetrax); дрофа-красотка (Chlamydotis undulatа); кречетка (Chettusia gregaria); чернобрюхий рябок (Pterocles orientalis); саджа (Syrrhaptes paradoxus); бурый голубь (Columba eversmanni); филин (Bubo bubo); азиатская широкоушка (Barbastella leucomelas); тянь-шанский бурый медведь (Ursus arctos isabellinus); каменная куница (Martes foina); перевязка (Vormela peregusna); среднеазиатская речная выдра (Lutra lutra seistanica); туркестанская рысь (Lynx lynx isabellinus); манул (Felis manul); туркменский кулан (Equus hemionus onager); джейран (Gazella subgutturosa); тянь-шанский горный баран-архар (Ovis ammon karelini); тугайный благородный олень (Cervus elaphus bactrianus).
Птицы представлены такими видами как: чибис (Vanellus vanellus); травник (Tringa totanus); бекас (Gallinago gallinago); луговая тиркушка (Glareola pratincola); обыкновенный фазан (Phasianus colchicus); перепел (Coturnix coturnix); луговой лунь (Circus pygargus); желтая трясогузка (Motacilla flava); черноголовая трясогузка (Motacilla feldegg); кулик-сорока (Haematopus ostralegus); малый зуек (Charadrius dubius); морской зуек (Himantopus himantopus); озерная чайка (Chroicocephalus ridibundus); речная крачка (Sterna hirundo), трясогузка.