Алматинский заповедник был учрежден 15 мая 1931 года как Мало-Алма-Атинский заповедник с площадью в 15 000 га. Постановлением ВЦИК и СНК 10 февраля 1935 года площадь его увеличена сначала до 40 000 га. В этом же году Постановлением Президиума ЦИК и СНК КазССР от 10 декабря к заыповеднику присоединили Жаланашскую и Согетинскую долины, площадь заповедника стала составлять 856 680 га. После этого он стал именоваться Алма-Атинским и, кроме территории бассейна Малой Алматинки, включал Жаланашскую и Согетинскую долины с прилегающими горами. К 1941 году площадь заповедника достигла почти одного миллиона гектаров и он считался тогда крупнейшим заповедником Советского Союза. Однако еще в 1939 году началась передача отдельных участков территории различным организациям: Горсовету Алма-Аты - 10 тыс.га в Мало-Алма-Атинском ущелье под размещение санаториев и домов отдыха; Наркомлесу - 69 тыс.га; Таучиликской лесной даче и т.д. К концу 1948 года территория заповедника составляла всего 298 600 га. В 1951 году заповедник был совсем ликвидирован. Только 31 июля 1961 года Постановлением Совета Министров Казахской ССР №524 заповедник восстановлен, но уже на другой территории - Чиликской, Табанкарагайской и Таучиликской лесных дач. Через три года, в 1964 г. он переносится на современную территорию - в бассейн реки Иссык и Талгар. Не без основания многие исследователи считают 1964 год, годом основания Алматинского заповедника. В 1966 году к заповеднику был присоединен пустынный участок "Поющая гора", но в январе 1983 года этот памятник природы был передан в ведение Капчагайского охотничьего хозяйства. Сейчас он находится на территории ГНПП "Алтын-Эмель".
Впервые был организован в 1931 году в Мало-Алматинском ущелье на площади 13 тыс. га. В феврале 1935 года его территория составляла 600 тыс. га, ему был присвоен статус государственного. В 1940 году площадь заповедника достигла около 1 мл. га. В послевоенные годы началось постепенное сокращение заповедных территорий и в сентябре 1951 года он был ликвидирован.
Вторично гос.заповедник был организован в 1961 году в Чиликском и Кегенском районах Алматинской области на площади 128 тыс.га. В 1964 году заповеднику была отведена новая площадь на землях Тургенского и Талгарского лесхозов. В 1966 году к нему был присоединен полупустынный участок Калканы на территории Кербулакского района, площадью 17850 га, который в 1983 году был изъят под Капчагайское охотничье-заповедное хозяйство.
В настоящее время Алматинский государственный природный заповедник расположен в юго-западной части Талгарского района Алматинской области в центральной части хребта Заилийский Алатау в пределах абсолютных высот от 1200 до 5000 м над уровнем моря. Центральная усадьба заповедника находится в городе Талгар, в микрорайоне Акку (Лебединка). Общая площадь заповедника составляет 71700 га.
Находится в ведении Комитета лесного хозяйства и животного мира Министерства экологии, геологии и природных ресурсов Республики Казахстан
Местонахождение: Алматинская область, Талгарский и Енбекшиказахский районы. 041600, город Талгар, поселок АККУ.
Описание границ. Заповедник расположен на юго-востоке Казахстана, в центральной части хребта Заилийский Алатау, который является крайней северной цепью горной системы Тянь-Шань. Основная часть заповедной территории, примерно три четверти, находится на
северном макросклоне хребта в бассейнах рек Талгар и Чилик. Западная граница территории проходит по реке Левый Талгар, северная по реке Правый Талгар, а восточная по гребню высокого отрога, разделяющего долины рек Есик и Тургень. Протяженность границы заповедника с запада на восток по прямой более 32 км. Остальная часть границы - южная проходит вблизи перевала Тогузак и через ледник Богатырь, верхнему течению реки Чилик до отрога между речками Косбулак-2 и Тамчи. Здесь расположена
остальная - меньшая часть заповедника, на ней представлены южные высокогорные склоны Заилийского Алатау. Охраняемая территория находится в пределах 1500 4979 м над уровнем моря. Кроме самой высокой вершины Заилийского Алатау - пика Талгар (4979 м), в заповеднике еще 4 вершины превышают 4500 м, это пики - Актау (4686 м), Корп (4631 м), Богатырь (4626 м) и Металлург (4600 м над ур. моря). Главный гребень хребта в пределах заповедника не опускается ниже 4200 м над ур. м.
Административно заповедник размещен на территории Талгарского и Энбекши-Казахского районов Алматинской области,
Республики Казахстан. Географические координаты центральной части охраняемой территории 42о96'05'/ 77o22'33''. Площадь охраняемой территории 71 700 га. Вокруг границы заповедника отведена 2-х километровая охранная зона площадью 8518 га. Территория заповедника разделена на два участка: Талгарский площадью 40652 га (105 кварталов), Есикский площадью 31048 га (36 кварталов). Всего 14 инспекторских обходов.
Центральная Усадьба заповедника находится в г. Талгаре. При центральной усадьбе есть «Музей природы», где экскурсионной службой заповедника демонстрируются природные компоненты
охраняемой территории (коллекции животных, растений, горных минералов и т.п.) и ведётся просветительская экологическая и природоохранная деятельность.
Флора заповедника самая разнообразная. Здесь встречаются и редкие растения Казахстана. Всего в заповеднике насчитывается 970 видов растений, среди которых числятся эндемики: касатик Альберта (Iris alberti); пастернаковник ледниковый (Pasternacopsis glacialis); курчавка Мушкетова (Atraphaxis muschketowii); вероника алатавская (Veronica alatavica); алмаатинский остролодочник (Oxytropis almaatensis); кайфмания (кортуза) Семенова (Kaufmannia semenovii) (Cortusa semenovii); ястребинка кумбельская (Pilosella kumbelica); алмаатинская наголоватка (Jurinea almaatensis).
На заповедной территории произрастают и растения Красной книги Казахстана: стланиковая форма ели Шренка (Picea schrenkiana); тюльпан Островского (Тulipa ostrovskiana); тюльпан Колпаковского (Тulipa kolpakovskiana); касатик (ирис) Альберта (Iris albertii); иридодикциум Колпаковского (Iridodictium kolpakowskianum); каркас кавказский (Celtis caucasica); ревень Виттрока (Rheum wittrockii); курчавка Мушкетова (Аtraphaxis muschketovii); пион гибридный (Paeonia hybrid); печеночница Фальконера (Hepatica falconeri); горицвет золотистый (Adonis chryzocyatus); голосемянник алтайский (Gymnospermium altaicum); хохлатка Семенова (Corydalis semenovii); желтушник шафранный (Erisimum croceum); голоплодник бесстрелковый (Lejospora excapa); смородина Янчевского (Ribes janczevskii); сибирка тяньшаньская (Sibiraea tianschanica); яблоня Сиверса (Malus sieversii); абрикос обыкновенный (Armeniaca vulgaris); молочай Ярослава (Euphorbia jaroslavii); пастернаковник ледниковый (Pastinacopsis glacialis); кауфмания Семенова (Kaufmannia semenovii); иконниковия Кауфмана (Ikonnikovia kaufmanniana); вероника алатавская (Veronica alatavica); шмальгаузения гнездистая (Schmalhausenia nidulans); горькуша обернутая (Saussurea involucrate); ястребинка кумбельская (Hieracium kumbelicum).
Встречаются в Алматинском заповеднике и ядовитые растения, самый знаменитый из которых — аконит джунгарский, он растет на обрывистых берегах горных рек и в густых еловых лесах.
Фауна. Всего в заповеднике живет 195 видов животных, из которых 37 — млекопитающие. В заповеднике гнездятся около 200 видов пернатых, многие из них занесены в Красную книгу Казахстана: аист черный (Ciconia nigra); лебедь-кликун (Cygnus cygnus); змееяд (Circaetus gallicus); орел-карлик (Hieraaetus pennatus); орел степной (Aquila nipalensis); могильник (Aquila heliacal); беркут (Aquila chrysaetos); бородач (Gypaetus barbatus); стервятник (Neophron percnopterus); кумай (Gyps himalayensis); балобан (Falco cherrug); шахин (Falco pelegrinoides); сапсан (Falco peregrinus); журавль серый (Grus grus); журавль-красавка (Anthropoides virgo); серпоклюв (Ibidorhyncha struthersii); филин (Bubo bubo); птица синяя (Myophonus coeruleus). Тянь-шанские медведи обитают в еловых лесах, но ближе к осени спускаются в луговую зону, где питаются яблоками. Всего в заповеднике насчитывается около 20 медведей. Тянь-шанские медведи обитают в еловых лесах, но ближе к осени спускаются в луговую зону, где питаются яблоками. Всего в заповеднике насчитывается около 20 медведей. Млекопитающие, внесенные в Красную книгу Казахстана - тяньшанский бурый медведь (Ursus arctos isabellinus); каменная куница (Martes foina); среднеазиатская речная выдра (Lutra lutra seistanica); манул (Otocolobus manul); туркестанская рысь (Lynx lynx isabellinus); снежный барс (Panthera uncia); архар (Ovis ammon). Из земноводных в болотистой местности обитает зеленая жаба. На склонах гор и в долинах заповедной территории живут пресмыкающиеся: ужи, гадюки, алайский гологлаз и узорчатый полоз. Имеются виды, включенные в Международный союз охраны природы и природных ресурсов (МСОП): пустельга степная (Falco naumanni); коростель (Crex crex); сизоворонка (Coracias garrulus); гриф черный (Aegypius monachus).